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1928. 組成データの相関係数 投稿者:北の大学院生 投稿日:2023/06/20 (Tue) 13:22:40: 杉本様
いつも大変お世話になっています。

最近、細菌叢解析で組成データの解析を行ってみたのですが、細菌の種類ごとに構成割合を％で出して、全体で100％になるデータです。
幾何平均でそれぞれを割り自然対数をとり、定数和制約をなくして解析をしてみたのですが、構成しているもののうち、１つは幾何平均値のための情報なので、無視して、偏相関係数を出してみたところ、やはり負の相関しかありませんでした。これはすべて足すと100％になるので、一方の割合が上昇すると他方は減少するという組成データの宿命を反映しているということであっているでしょうか。

また、組成データの良い解析方があったら教えていただければ幸いです。

ご教授お願いいたします。

下記URLから得た公開データで解析してみたところ、日本人の４つの地域や性別で主要な門レベル４つの細菌叢の構成割合はほとんど同じでした。
日本人は皆さん同じような食生活などであることが推察されます。
https://microbiome.nibiohn.go.jp/

今後ともよろしくお願いいたします。