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1942. Re[1941]:[1940]:細菌叢解析 投稿者:北の大学院生 投稿日:2023/07/19 (Wed) 16:51:39: 杉本様
いつも大変お世話になっています。

組成データ解析入門―パーセント・データの問題点と解析方法―
朝倉書店

で紹介されていた、不変成分を特定して基準とする方法に関してあっているかどうかよくわかりませんが、テストを行ってみたところ下記のようになり（結果は数字だ大きめのほう、出現回数が多いほうが不変成分の可能性がある）、Bacteroidetesは誰もが同じ数を持っていて、これの数をそろえることで、他の数を出して比較する方法でもよい可能性がありました。（絶対量変動法；変動係数法より）

F/B　ratioはよい指標なのかもしれません。

> result12
Firmicutes Bacteroidetes Actinobacteria Proteobacteria
[1,] 0 1 3 2

> #test2

> result21
[,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] "Firmicutes/Bacteroidetes" "Firmicutes/Actinobacteria" "Firmicutes/Proteobacteria" "Bacteroidetes/Firmicutes"
[,5] [,6]
[1,] "Bacteroidetes/Actinobacteria" "Bacteroidetes/Proteobacteria"

今後ともよろしくお願いいたします。