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1964. Re[1963]:[1962]:解析について 投稿者:北の大学院生 投稿日:2023/09/15 (Fri) 22:18:17: 杉本様
いつも大変お世話になっています。

丁寧なご回答をありがとうございます.

私の考えが浅かったです。
少数例では母集団の推測は行えないという当たり前のことを忘れて、主成分分析や因子分析、他の回帰分析もある程度サンプルサイズが必要でした。
主成分分析や因子分析は特に勉強不足でした。もう一度じっくり学習しなおします。

SNPはお金がかかるので3対3が限界だったそうです。
ある程度お金をかけて解析できる必要最小限のサンプリングを行ったほうが多くのことが分かり、よい研究になると実感してしまいます。
MA plotを90度回転させて、volcano plotと見た目を同じにして、volcano plotであるかのような感じで行けば、見た目重視派には同じに見えてそのままいけそうな気がします。
私もMA plotを提案していました。

ノンパラメトリック手法とセミパラメトリック手法は前近代科学的な統計手法ですが、医学や歯学は伝統を重んじる傾向があるので、おそらくまだ前近代科学の伝統を重んじて時間依存解析を行っていると推察されます。
統計ソフトのデフォルトもセミパラメトリックやノンパラメトリックな方法しか搭載されていないのも理由の一つだと思われました。
さらにとりあえずデフォルトでよくわからないけどやってみて意味ありそうで論文にすることもありうるためだと思います。

いつもありがとうございます。
今後ともよろしくお願いいたします。